Follow FrankTwisk on Twitter  
   

 

 

 

 

Kerr:

 

7 subgroepen

op basis van

afwijkende genenaktiviteit

(vervolg)

 

 

 

 


 

In navolging op een eerdere studie (klik hier voor meer informatie over die studie)

verscheen onlangs een nieuwe studie van dr. Kerr en kollega's naar subgroepen.

 

In twee stappen werd vastgesteld dat bij de groep CVS-patiŽnten (als geheel)

de genenaktiviteit (eiwitproduktie) van 88 genen afwijkt t.o.v. gezonde proefpersonen.

 

Dat wil overigens niet zeggen dat de aktiviteit van alle 88 genen bij elke patiŽnt afwijkt.

Wel blijkt uit het studierapport dat ook bij subgroepen de aktiviteit van de meeste genen bij elk van de subgroepen, gemiddeld gesproken, afwijkt van gezonde mensen.

 

De genen, waarvan de aktiviteit bij de patiŽnten afwijkt, hebben vooral te maken met:

  • bloedafwijkingen,
  • het afweersysteem,
  • kanker,
  • apoptose (celsterfte) en
  • infekties.

Gezien eerdere bevindingen/klachten zal dat de meeste patiŽnten niet verbazen!

De vermoeidheidsdeskundigen en psycheuten waarschijnlijk wel....

 

Er zijn ook een aantal "afwijkende genen" die in verband gebracht worden met neurologische ziekten (wederom een aanwijzing dat Myalgische Encephalomyelitis,

en niet Myalgische Encephalopathie, een juiste benaming van de ziekte is).

 

Een relatief groot aantal genen waarvan de aktiviteit, gemiddeld gesproken, afwijkt,

hebben betrekking op een aktieve Epstein-Barr-infektie (EBV, klierkoorts: klik hier).

 

 

 

 

Op basis van afwijkende genenaktiviteit (de genen wijken niet af, maar het gebruik ervan) werden 7 subgroepen afgeleid. Kanttekening: de subgroepen waren soms zeer klein!

 

Tenslotte werd vastgesteld dat (de ernst van) de verschillende klachten/symptomen van de zeven subgroepen een direkt verband hadden met de afwijkende genenaktiviteit.

 

Om misverstanden te voorkomen: het draait om de ernst van een klacht in een subgroep. Want alle patiŽnten voldeden aan de Fukuda-kriteria (4, 5, 6, 7 of 8 nevensymptomen).

 

Gezien de grootte van de subgroepen (soms maar 2 patiŽnten) kunnen aan die laatste konstatering, denk ik, nog niet al te veel konklusies aan dat verband verbonden worden.

 

Wat ook opvalt is dat het aantal mensen in subgroep 4 en 6 (mensen die er relatief beter aan toe zijn) erg groot is. Samen vormen zij meer dan 60% van de totale patiŽntengroep.

Dat zou kunnen komen doordat "zware gevallen" relatief moeilijker deelnemen.

 

Gezien het geringe budget waarmee Kerr en kollega's zich moet behelpen, en

de hoge kosten die genenaktiviteit-studies vaak met zich mee brengen,

verdient het werk van Kerr, Enlander en anderen grote bewondering.

Maar het zou goed zijn als deze studie met een grotere groep patiŽnten herhaald werd.

 

Wat uiteraard interessant is, maar dit wordt in een toekomstige studie uitgewerkt,

is de relatie tussen specifieke klachten en specifieke afwijkende genenaktiviteit.

 

 


 

Interessante citaten uit het studierapport:

 

 

The functions of these genes present a complex picture with links to several diseases and pathways. Prominent themes that are well recognized in patients with CFS/ME are immunity, inflammation, and infection; cell death; cancer; and neurological disease.

 

Within the gene signature identified in this study, the following 12 human genes that we found to be upregulated in patients with CFS/ME have been shown elsewhere to be upregulated, either directly or indirectly, by EBV infection. A particularly interesting gene is EBI2, which was upregulated in 55% of patients with CFS/ME, ....

 

The theme of neurological disease and function was prominent among the 88 CFS/ME-associated genes, almost all of which are expressed in multiple areas of the human brain.

 

Clustering of logarithm (base 2) fold differences Ö emphasizes the predominance of upregulation for most genes in all CFS/ME subtypes.

 

Another interesting gene that affects neurological function is EIF2B4, mutations within which are associated with vanishing white matter disease. This is interesting in view of the white matter hyperintensity lesions that have been documented in patients with CFS/ME.

 

 


 

Gene expression subtypes in patients with chronic fatigue syndrome/myalgic encephalomyelitis.

J Infect Dis. 2008 Apr 15;197(8):1171-84.

Kerr JR, Petty R, Burke B, Gough J, Fear D, Sinclair LI, Mattey DL, Richards SC, Montgomery J, Baldwin DA, Kellam P, Harrison TJ, Griffin GE, Main J, Enlander D, Nutt DJ, Holgate ST.

 

 

Chronic fatigue syndrome/myalgic encephalomyelitis (CFS/ME) is a multisystem disease, the pathogenesis of which remains undetermined.

 

We set out to determine the precise abnormalities of gene expression in the blood of patients with CFS/ME.

 

We analyzed gene expression in peripheral blood from

25 patients with CFS/ME diagnosed

according to the Centers for Disease Control and Prevention diagnostic criteria and

50 healthy blood donors,

using a microarray with a cut-off fold difference of expression of >or=2.5.

 

Genes showing differential expression were further analyzed in

55 patients with CFS/ME and

75 healthy blood donors,

using quantitative polymerase chain reaction.

 

Differential expression was confirmed for 88 genes;

85 were upregulated, and

3 were downregulated.

 

Highly represented functions were:

  • hematological disease and function,
  • immunological disease and function,
  • cancer,
  • cell death,
  • immune response, and
  • infection.

Clustering of quantitative polymerase chain reaction data from patients with CFS/ME revealed 7 subtypes with distinct differences in Medical Outcomes Survey Short Form-36 scores, clinical phenotypes, and severity.

 

 

PMID: 18462164 [PubMed - in process]

 

 

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18462164?ordinalpos=1

&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum